צבי הנינג'ה חוזרים להגן על רחובות ניו יורק - והפעם באנימציה ממוחשבת תלת מימדית (CGI)המתאימה למאה ה-21. אחרי שהביסו את אויבם המושבע שרדר, צבי הנינג'ה מתרחקים זה מזה בתור משפחה: דונטלו ומיכאלאנג'לו עסוקים בעבודות רגילות, רפאל ישן כל היום אבל בלילה הוא נ